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ANATOMIA DEL GENOMA PROCARIOTICO
Paragrafo 4.3
[
91
]
121
128
117
105
112
104
118
110
119
101
113 210
209
144
111
133
14
16
216
25
315
124
185
20
ilv
E
D
AC
Z
I
129
140
141
102
50
116
15
108
122
142
32
143
42
251
250
200
254
152
8
100
147
106
123
125
148
126
131
103
44
150
203
thr
proA
lac
purE
nadA
chlA
leu
proB
proC
lip
galO
100/0
Min 10
20
30
40
50
60
70
80
90
lac Y
ilve
rbs
pyrE
mil
metB
bgl
supN
argH
asd
argR
argG
metC
serA
lysA
fuc
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guaB
ctr
dsdA
malB
purA
pyrB
melA
pyrD
trp
aroH
zwf
his
man
supD
pyrC
cheC
FIGURA 4.8
X
Mappa del genoma di
E. coli
. È mo-
strato il genoma del ceppo K-12 comunemente usato
in laboratorio. L’utilizzo del tempo in minuti come
unità di misura del genoma (all’interno del cerchio)
è dovuto al tempo impiegato (100 minuti circa) per il
trasferimento dell’intero cromosoma batterico dalla
cellula donatrice a quella ricevente nella coniugazio-
ne batterica. In questa mappa, l’origine di replica-
zione è a 85 minuti circa; con la sigla e il colore blu
sono indicati alcuni geni. Esternamente, i numeri e le
frecce indicano specifici ceppi donatori Hfr. Per ogni
ceppo Hfr, l’apice della freccia indica il punto iniziale
del trasferimento di DNA. Il frammento del genoma
batterico presente nel plasmide F
9
è indicato dall’arco
corrispondente al segmento della mappa circolare di
E. coli
.
TABELLA 4.1
T
Organizzazione e dimensioni di alcuni genomi procariotici
Specie
Tipologia
Cromosomi Plasmidi
Lunghezza
totale media
(Mbp)
Geni
codificanti
proteine
GC
mediana
(%)
Codice
RefSeq
Aquifex aeolicus
Ipertermofilo
1 (circolare)
1
1,59
1526
43,3 NC_000918.1
NC_001880.1
Bifidobacterium bifidum
Probiotico
1 (circolare)
–
2,21
1705
62,7 NC_014638.1
Borreliella burgdorferi
Patogeno (malattia di lyme)
1 (lineare)
fino a 20
1,21
942
28,3 NC_001318.1
NC_001850.1
Agrobacterium fabrum
Patogeno vegetale
1 (lineare)
1 (circolare)
2
5,67
5355
59,1 NC_003062.2
NC_003063.2
NC_003065.3
NC_003064.2
Deinococcus radiodurans
Radio-resistente
2 (circolare)
2
3,24
3022
66,8 NC_001263.1
NC_001264.1
NC_000958.1
NC_000959.1
Vibrio cholerae
Patogeno (colera)
2 (circolare)
–
4,02
3590
47,5 NC_002506.1
NC_002505.1
Escherichia coli K-12
Enterico
1 (circolare)
–
4,64
4140
50,8 NC_000913.3
Escherichia coli O157
Enterico patogeno
1 (circolare)
2
5,60
5292
50,5 NC_002695.1
NC_002127.1
NC_002128.1
Mycobacterium
tuberculosis
Patogeno (tubercolosi)
1 (circolare)
–
4,41
3906
65,6 NC_000962.3
Rickettsia prowazekii
Patogeno (tifo)
1 (circolare)
–
1,11
850
29 NC_000963.1
Neisseria meningitidis
Patogeno (meningite)
1 (circolare)
–
2,16
2050
51,8 NC_003112.2
Mycoplasma genitalium
Patogeno (infezioni genitali
e respiratorie)
1 (circolare)
–
0,5797
484
31,7 NC_000908.2